Software Supercomputación ESPE

HPC es una instalación donde los estudiantes y los investigadores pueden ejecutar sus simulaciones, pero también un laboratorio donde desarrollar un nuevo software aprovechando todas las posibilidades del moderno High Performance Computing, y experimentar con diferentes soluciones. Por esta razón, un extenso conjunto de paquetes de software, herramientas de desarrollo y bibliotecas está disponible y constantemente actualizado. El personal de HPC se encarga de la instalación, la gestión y el mantenimiento del software, prestando atención tanto a la fiabilidad y el rendimiento.

Algunas de las aplicaciones son instaladas y mantenidas por la pila de software responsable de algunos de los propietarios del clúster. De esta manera, los usuarios de otros grupos pueden beneficiarse del conocimiento en otros departamentos o grupos de investigación. El software HPC se divide en dos categorías: Aplicaciones HPC y Herramientas de desarrollo HPC, como compiladores, depuradores, etc.

Más Información

Software Científico

SoftwareÀreaSubáreaLicenciaComentario
BEAST

beast
BiologìaAnálisis BayesianoLibreBEAST es un programa multi-plataforma para el análisis Bayesiano de secuencias moleculares utilizando MCMC.
MatLab

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GeneralAnálisis numéricosLicenciadoMatLAb es una herramienta de software matemático que ofrece un entorno de desarrollo integrado (IDE) con un lenguaje de programación propio (lenguaje M).
Namd

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BiologíaAnálisis MolecularLibreEs un código de dinámica molecular paralelo diseñado para la simulación de alto rendimiento de grandes sistemas biomoléculas
VMD

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BioinformáticaAnálisis MolecularLibreEs un programa de visualización molecular para mostrar, animar y analizar grandes sistemas biomoleculares utilizando gráficos en 3-D y scripts incorporados.
ChromEvol

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Análisis MolecularLibreEs un programa libre, de código abierto para analizar los cambios en el número de cromosomas a lo largo de una filogenia.
QIIME

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BioinformáticaLibreEs un programa de bioinformática para realizar análisis de microbiomas a partir de datos de secuenciación de ADN sin procesar.
MZmine

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BioinformáticaLibreEs un software de código abierto para el procesamiento de datos de espectrometría de masas, con el foco principal en los datos de LC-MS.
Garli

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BioinformáticaLibreRealiza búsquedas filogenéticas heurísticas bajo el modelo general de tiempo reversible (GTR) de sustitución de nucleótidos y sus submodelos, con o sin heterogeneidad de la tasa distribuida gamma y una proporción de sitios invariantes.
Galaxy

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BioinformáticaLibreGalaxy es una plataforma abierta basada en web para la investigación biomédica intensiva de datos. Ya sea en el servidor público gratuito o en su propia instancia, puede realizar, reproducir y compartir análisis completos.